Вопросам борьбы с коррупцией уделяется очень большое внимание, поэтому одной из важнейших задач министерства сельского хозяйства и продовольствия Самарской области, как и всех органов исполнительной власти, является разработка и реализация мероприятий по противодействию коррупции. На постоянной основе ведётся разъяснительная работа по своевременному и полному представлению гражданскими служащими министерства сведений о доходах, расходах, об имуществе и обязательствах имущественного характера, ежегодно проводятся совещания с участием представителей прокуратуры Самарской области.
В целях повышения эффективности деятельности министерства в сфере противодействия коррупции в декабре 2014 года образована комиссия по противодействию коррупции в министерстве, в состав которой вошли представители ГУ МВД России по Самарской области и Общественного совета министерства. Следует отметить, что комиссии по противодействию коррупции образованы также во всех государственных бюджетных учреждениях, подведомственных министерству.
Министерством осуществляется также взаимодействие с Управлением налоговой службы по Самарской области: ежеквартально проводится обновление сведений, содержащихся в программном комплексе «Запросная система ЕГРИП и ЕГРЮЛ 2008», который позволяет управлению государственной службы и противодействия коррупции департамента правового обеспечения и государственной службы проводить проверки граждан, претендующих на замещение вакантных должностей гражданской службы, а также их супругов на предмет выявления лиц, входящих в учредители и органы управления коммерческих организаций или являющихся индивидуальными предпринимателями.
